2026년 의료비 세액공제, 총급여 3% 문턱과 실손보험금 빼는 법

2026년 의료비 세액공제는 한 해 동안 낸 의료비 가운데 총급여의 3%를 넘는 금액에 15%를 공제합니다(소득세법 제59조의4 제2항). 본인·6세 이하·65세 이상·장애인·중증질환자를 위한 의료비는 한도가 없고, 그 밖의 가족 의료비는 연 700만 원까지입니다. 미숙아·선천성이상아 의료비는 20%, 난임시술비는 30%로 더 높습니다. 실손보험금으로 돌려받은 금액은 빼고 셉니다(시행령 제118조의5 제1항).

연말정산 때 병원비 영수증을 한 뭉치 모아 두고 기대했다가 환급이 거의 없어 놀라는 경우가 많습니다. 총급여 5천만 원이면 150만 원까지는 아무리 써도 공제가 0원이고, 실손보험으로 돌려받은 돈과 50만 원을 넘는 안경값은 빠지기 때문입니다. 그래서 권하는 방식은 먼저 내 총급여의 3%가 얼마인지 셈하고, 간소화 자료의 의료비에서 실손보험금 받은 금액을 뺀 다음, 맞벌이라면 문턱이 낮은 쪽이 낸 의료비가 얼마인지 보는 순서입니다.

누구를 위해 무엇에 썼는지로 공제율과 한도가 갈립니다

의료비 세액공제는 같은 100만 원이라도 누구의 의료비인지, 어떤 치료인지에 따라 공제율과 한도가 다릅니다.

6세 이하는 과세기간이 시작하는 2026년 1월 1일 현재 6세 이하인 아이, 곧 6세가 되는 날이 그날이거나 그 뒤인 아이입니다(제12조 제3호 머목의 뜻을 제59조의4에도 씀). 65세 이상은 2026년 12월 31일 현재로 보므로 1961년 12월 31일 이전에 태어난 부모님이 들어갑니다. 중증질환자·희귀난치성질환자·결핵환자는 건강보험에서 본인부담을 낮춰 주는 산정특례 요양급여를 받는 사람 가운데 재정경제부령으로 정한 사람이고(시행령 제118조의5 제4항), 미숙아는 미숙아 출생을 원인으로 특별한 의료적 관리가 필요하다고 인정된 치료비, 선천성이상아는 그 질환 치료비만 해당합니다(같은 조 제5항).

공제 대상 가족은 기본공제대상자이되 나이와 소득 제한을 받지 않습니다(제59조의4 제2항). 그래서 소득이 있어 기본공제를 못 받는 배우자나, 60세가 안 된 부모님(생계를 같이 하는 경우)을 위해 낸 의료비도 들어갑니다.

3% 문턱은 일반 가족 의료비부터 채운 것으로 봅니다

문턱을 어느 의료비로 채웠다고 보느냐가 계산의 핵심입니다. 법은 일반 가족 의료비(제1호)로 먼저 총급여의 3%를 채우고, 모자라면 본인·65세 이상 등의 의료비(제2호)에서, 그래도 모자라면 미숙아(제3호), 난임시술비(제4호) 순서로 뺍니다(제59조의4 제2항 각 호 단서).

마지막 줄처럼 일반 가족 의료비가 문턱을 넘고도 700만 원 한도에 걸리면, 문턱 위 880만 원 가운데 700만 원만 인정되고 본인 의료비 100만 원은 한도와 상관없이 그대로 더해집니다. 문턱을 공제율이 같거나 낮은 쪽부터 채우는 구조라, 난임시술비나 미숙아 의료비처럼 공제율이 높은 돈은 문턱에 먼저 쓰이지 않습니다.

난임시술비는 30%라 다른 의료비가 문턱을 먼저 채우면 유리합니다

난임시술은 모자보건법의 보조생식술을 말하고(시행령 제118조의5 제6항), 시술과 관련해 처방받은 의약품 구입비도 함께 들어갑니다(법 제59조의4 제2항 제4호). 공제율이 30%로 가장 높고 한도가 없으며, 문턱은 일반 의료비·본인 의료비·미숙아 의료비로 먼저 채운 것으로 보고 그래도 모자란 만큼만 난임시술비에서 뺍니다.

일반 의료비 200만 원이 더해졌을 뿐인데 공제가 57만 원 늘어나는 까닭은, 그 돈이 문턱을 대신 채워 30%짜리 난임시술비 180만 원이 온전히 살아났기 때문입니다. 같은 해에 가족 병원비가 따로 있었다면 빠뜨리지 않고 넣는 편이 난임 가정에는 특히 이익입니다.

영수증 720만 원을 모은 총급여 5천만 원 가장

총급여 5천만 원을 받는 외벌이 직장인이 1월 연말정산을 앞두고 지난해 의료비 영수증을 모읍니다. 70세 아버지 무릎 수술비 500만 원(실손보험금 200만 원 받음), 본인 치과 치료 60만 원, 전업주부인 아내 진료비 50만 원, 8살 아이 안경 두 개 70만 원과 소아과 진료비 40만 원으로 영수증 합계가 720만 원입니다. 문턱은 5천만 원의 3%인 150만 원입니다.

지방소득세 10%까지 더하면 세금이 57만 7,500원 줄어듭니다. 이 사람이 실손보험금을 빼지 않고 넣었다면 공제 대상이 550만 원으로 잡혀 30만 원을 더 공제받은 셈이 되고, 나중에 고쳐 내야 합니다. 아이 안경값 70만 원을 그대로 넣었다면 일반 의료비가 160만 원이 되어 문턱을 10만 원 넘기고 본인·아버지 의료비도 깎이지 않으므로 공제가 3만 원 더 붙는데, 이것도 50만 원 한도를 넘는 몫이라 인정되지 않습니다. 영수증 합계보다 「무엇을 빼야 하는가」를 먼저 보는 편이 결과가 정확합니다.

실손보험금은 의료비가 생긴 해에서 뺍니다

의료비는 근로자가 직접 부담한 금액만 들어가고, 보험회사에서 받은 실손의료보험금은 빼고 셉니다(시행령 제118조의5 제1항). 국세상담센터는 2025년에 병원비를 내고 2026년에 실손보험금을 받았다면, 그 보험금은 보험금 수령의 원인이 된 해, 곧 병원비를 낸 2025년 의료비에서 뺀다고 안내합니다. 연말정산을 끝낸 뒤에 보험금을 받았다면 그 해 공제를 다시 맞춰야 한다는 뜻입니다.

간소화 자료에 잡힌 병원비가 실제로 낸 돈과 다른 경우도 흔합니다. 미용·성형수술 비용과 건강증진을 위한 의약품 구입비는 의료기관이나 약국에 냈어도 대상이 아니고(같은 조 제2항), 반대로 간소화에 안 잡히는 경우가 있는 안경점·보청기 판매점 비용은 영수증을 따로 받아 넣어야 합니다.

안경·산후조리원·보청기처럼 따로 정한 항목

의료기관에 낸 진료비와 약국 약값 말고도 시행령이 의료비로 정해 둔 항목이 있습니다. 한도가 붙은 것과 없는 것을 나눠 보면 이렇습니다.

산후조리원 비용은 예전에 총급여 7천만 원 이하 조건이 붙어 있었지만, 지금 시행령 조문에는 출산 1회당 200만 원 한도만 남아 있습니다(제118조의5 제1항 제7호, 2024. 2. 29. 개정). 국세상담센터 문답에는 아직 총급여 조건이 적힌 옛 설명이 남아 있어 헷갈리기 쉬운데, 공제 여부는 조문이 기준입니다.

맞벌이라면 누가 냈는지가 공제를 가릅니다

의료비는 「해당 근로자가 직접 부담하는」 금액이라(시행령 제118조의5 제1항), 아내 카드로 낸 남편 병원비는 남편이 아니라 아내가 공제받습니다. 국세상담센터도 맞벌이 부부가 배우자를 위해 의료비를 냈으면 낸 근로자 본인이 공제받는다고 안내합니다. 다만 자녀 의료비는 그 자녀의 기본공제를 받는 사람이 냈을 때만 공제됩니다.

총급여 7천만 원인 남편(문턱 210만 원)과 3천만 원인 아내(문턱 90만 원)가 있고, 아이 기본공제는 아내가 받는다고 해 보겠습니다. 올해 아이 진료비 150만 원과 남편 치과 치료비 100만 원을 모두 아내 카드로 내면 일반 의료비 250만 원에서 90만 원을 뺀 160만 원이 공제 대상이라 세액공제가 24만 원입니다. 남편이 자기 치과비만 냈다면 100만 원이 문턱 210만 원에 못 미쳐 0원입니다. 문턱이 낮은 쪽으로 결제를 모으는 편이 대개 유리하지만, 그 사람에게 공제받을 세금이 충분히 남아 있어야 합니다.

카드로 낸 병원비는 신용카드 소득공제에도 함께 들어갑니다. 신용카드 공제에서 빼는 사용액 목록(조세특례제한법 시행령 제121조의2 제6항)에 의료비가 없기 때문입니다. 자세한 카드 공제 계산은 신용카드 소득공제 글에 정리했습니다.

공제는 남은 세금 안에서, 표준세액공제와는 하나만

보험료·의료비·교육비 세액공제와 월세 세액공제의 합계가 근로소득에 대한 산출세액을 넘으면 그 넘는 금액은 없는 것으로 봅니다(제61조 제1항). 기부금과 달리 다음 해로 넘어가지 않으므로, 세금이 거의 남지 않는 사람에게 큰 의료비를 몰아주면 공제가 버려집니다.

또 의료비 같은 특별세액공제나 건강·고용보험료 소득공제를 신청하면 표준세액공제 13만 원은 받을 수 없습니다(제59조의4 제9항 제1호). 국세상담센터는 둘을 함께 받을 수 없고 유리한 쪽을 적용한다고 안내합니다. 의료비 공제가 몇만 원에 그치고 다른 특별세액공제가 없다면 표준세액공제 쪽이 나을 수 있으므로, 연말정산 결과에서 어느 쪽이 적용됐는지 확인하는 편이 좋습니다.

과세기간 중에 혼인·이혼·취업 등으로 기본공제대상자에서 빠진 가족을 위해 낸 의료비는 그 사유가 생긴 날까지 낸 금액만 공제됩니다(제59조의4 제5항).

확인하지 못한 것과 계산에서 정한 것

• 사례의 공제액은 법정 세액공제액이고, 그 사람에게 남은 세금이 공제액보다 많다고 보고 계산했습니다. 남은 세금이 적으면 제61조 제1항 때문에 실제 환급이 더 작습니다.
• 형제가 나눠 부모님 의료비를 낸 경우처럼 기본공제를 받는 사람과 의료비를 낸 사람이 다를 때의 처리는 자녀 의료비 안내 말고는 이번 글에서 확인하지 못했습니다.
• 산후조리원 비용의 총급여 조건이 없어진 시점은 시행령 개정일(2024. 2. 29.)로 적었고, 개정 부칙의 적용 연도는 따로 확인하지 못했습니다. 2026년 지출분은 지금 조문대로 200만 원 한도만 봅니다.
• 중증질환자의 구체적 범위는 재정경제부령과 건강보험 산정특례 등록 여부를 따르므로, 해당되는지는 병원의 산정특례 안내로 확인해야 합니다.

정리하면

2026년 의료비 세액공제는 총급여의 3%를 넘는 의료비에 15%(미숙아 20%, 난임시술 30%)를 공제하고, 일반 가족 의료비만 연 700만 원 한도가 있으며 본인·6세 이하·65세 이상·장애인 의료비는 한도가 없습니다. 문턱은 일반 가족 의료비부터 채우고, 실손보험금은 병원비를 낸 해에서 빼며, 안경은 1명당 50만 원, 산후조리원은 출산 1회당 200만 원까지만 넣습니다. 맞벌이라면 낸 사람이 공제받으므로 문턱이 낮은 쪽으로 결제를 모으되 그 사람의 남은 세금을 함께 봐야 합니다. 공제 전체의 흐름은 연말정산 환급금 조회 글과 부양가족 기본공제 글로 이어서 볼 수 있습니다.

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