중도퇴사자 연말정산 2026, 퇴사 달 정산부터 5월 종합소득세 신고까지

2026년 중간에 회사를 그만두면 그해 연말정산은 이듬해 2월까지 기다리지 않고, 퇴사하는 달의 급여를 줄 때 회사가 끝냅니다(소득세법 제137조 제1항). 그 전에 공제 서류를 내지 않으면 회사는 본인 기본공제와 표준세액공제만 넣고 정산하는데(같은 조 제3항), 한 해의 절반만 일한 사람은 이것만으로도 대개 세금을 돌려받습니다. 매달 떼는 소득세는 퇴사할 줄 모르고 월급 기준으로 뗀 금액이기 때문입니다. 정산 때 빠진 공제는 다음 해 5월 종합소득세 신고로 넣거나, 그때를 놓쳐도 5년 안에 경정청구로 넣을 수 있습니다. 다만 보험료·의료비·교육비 세액공제와 신용카드 소득공제는 근로를 제공한 기간에 쓴 돈만 들어가고, 퇴사한 뒤 쓴 돈은 넣을 수 없습니다.

퇴사 마지막 달 급여명세서에 소득세가 마이너스로 찍혀 있는 것을 보고 「회사가 잘못 넣은 것 아닌가」 하고 묻는 경우가 많습니다. 그 마이너스가 바로 퇴사 달 연말정산의 환급금인데, 그걸 모르고 지나가면 5월에 무엇을 더 넣어야 하는지도 모른 채 한 해가 넘어갑니다. 그래서 권하는 방식은 퇴사를 알리는 날 회사에 공제신고서를 낼지부터 정하고, 내지 못했다면 퇴사 달 급여명세서와 원천징수영수증을 받아 둔 다음, 이듬해 5월에 홈택스에서 근로기간 중 쓴 의료비·카드 사용액을 불러와 신고하는 순서입니다. 같은 해에 다시 취업한다면 전 직장 원천징수영수증을 새 회사에 내는 것 하나로 끝납니다.

퇴사하는 달 급여에서 연말정산이 끝납니다

소득세법은 연말정산을 하는 때를 둘로 정합니다. 계속 다니는 사람은 「해당 과세기간의 다음 연도 2월분의 근로소득」을 줄 때, 퇴직자는 「퇴직하는 달의 근로소득」을 줄 때입니다(제137조 제1항). 퇴직자의 과세기간은 1월 1일부터 퇴직하는 날까지로 보고(같은 항 제1호), 이 기간의 근로소득을 모아 공제를 넣고 세금을 다시 계산합니다.

공제를 받으려면 근로소득자 소득·세액 공제신고서를 퇴직한 날이 속하는 달의 근로소득을 받기 전에 회사에 내야 합니다(제140조 제1항). 이 신고서를 내지 않은 사람에게는 기본공제 중 본인분과 표준세액공제만 적용합니다(제137조 제3항). 부양가족이 있어도, 병원비를 많이 썼어도 이때는 반영되지 않는다는 뜻입니다. 대신 이 정산에서 빠진 공제는 뒤에서 다룰 5월 신고로 다시 넣을 수 있습니다.

정산이 끝나면 회사는 원천징수영수증을 줘야 합니다. 계속 다니는 사람은 다음 연도 2월 말일까지이지만, 중도에 퇴직한 사람에게는 퇴직한 날이 속하는 달의 근로소득 지급일이 속하는 달의 다음 달 말일까지 발급해야 합니다(제143조 제1항 단서). 이 영수증이 5월 신고와 재취업 정산에 모두 쓰이므로 꼭 받아 두는 편이 좋습니다. 마지막 근무일이 12월 31일인지 1월인지에 따라 정산이 한 번으로 끝나는지 둘로 나뉘는지는 12월 퇴사 vs 1월 퇴사 글에서 퇴직금·보험과 함께 견주었습니다.

날짜로 짚어 보면 이렇습니다

2026년 6월 30일에 퇴사하고 6월분 급여를 7월 10일에 받는 사람을 예로 들면 일정은 다음과 같습니다.

법은 급여 지급일 자체를 정하지 않으므로, 실제 정산 날짜는 회사 급여일에 따라 달라집니다. 퇴사 달 급여가 다음 달로 넘어가 지급되는 회사라면 정산도 그때 이뤄집니다.

퇴사자는 대개 돌려받습니다 — 월급 400만 원, 6월 퇴사 사례

비과세 수당 없이 월급 400만 원을 받던 1인 가구 직장인이 2026년 6월 30일에 퇴사하고, 공제신고서를 내지 않아 본인 기본공제와 표준세액공제만 넣고 정산한 경우입니다. 매달 뗀 소득세는 근로소득 간이세액표에서 월급 400만 원·공제대상가족 1명 칸의 금액인 19만 5,960원으로 두었습니다.

근로소득공제는 소득세법 제47조 제1항, 기본공제 150만 원은 제50조 제1항, 세율은 제55조 제1항, 근로소득세액공제와 그 한도는 제59조, 표준세액공제는 제59조의4 제9항 제1호입니다. 개인지방소득세도 소득세의 10%만큼 함께 정산되므로 9만 원 남짓이 더 돌아옵니다.

환급이 이렇게 큰 까닭은 두 가지입니다. 첫째, 간이세액표는 월급과 가족 수만 보고 떼는 표라 그 사람이 한 해 중간에 그만둘지 알지 못합니다. 둘째, 반년 치 소득 2,400만 원의 과세표준은 1,400만 원 아래라서 가장 낮은 6% 세율만 걸리고, 근로소득세액공제가 산출세액의 55%를 한 번 더 깎습니다. 이 사례는 국민연금·건강보험료 공제를 넣지 않은 계산이라, 회사가 그 공제까지 넣어 정산하면 결정세액은 조금 더 내려갑니다. 내 월급과 퇴사한 달로 같은 계산을 해 보려면 중도퇴사 연말정산 계산기에 월 과세 급여와 근무한 달 수를 넣으면 되고, 매달 떼는 4대보험과 소득세 항목은 연봉 실수령액 계산기에서 볼 수 있습니다.

5월에 넣을 수 있는 것과 넣을 수 없는 것

퇴사 달 정산에서 빠진 공제를 5월에 넣을 때 가장 먼저 가려야 하는 것이 「언제 쓴 돈인가」입니다. 국세청은 과세기간 중에 취업하거나 퇴사한 사람은 근로제공기간 동안 지출한 비용에 한하여 특별세액공제를 받는다고 안내하고, 기부금만 이 제한에서 뺍니다. 의료비는 취업 전·퇴직 후 지출분을 공제받을 수 없다고 국세상담센터가 답하고 있고(근거 소득세법 제59조의4 제2항), 신용카드 사용액도 근로제공기간 사용분만 공제 대상이라 입사 전·퇴사 후 사용액은 넣을 수 없다고 안내합니다(소득세법 집행기준 52-0-1).

부양가족 기본공제는 퇴사 달 정산에서 가장 많이 빠지는 항목입니다. 공제신고서를 안 내면 본인분만 들어가기 때문에(제137조 제3항), 소득이 없는 배우자나 부모님을 부양하고 있었다면 5월 신고에서 반드시 챙겨야 합니다. 부양가족이 기본공제 대상인지는 나이와 소득 요건으로 가리며, 근로소득만 있는 가족은 총급여 500만 원 이하여야 합니다(제50조 제1항).

공제를 더 넣어도 줄어드는 폭은 크지 않습니다

위 사례의 결정세액은 23만 8,550원입니다. 5월에 공제를 아무리 많이 넣어도 결정세액이 0원 아래로 내려가지는 않으므로, 이 사람이 5월 신고로 더 돌려받을 수 있는 소득세는 많아야 이 23만 8,550원 안입니다. 퇴사 달 정산에서 이미 대부분을 돌려받았기 때문입니다. 공제마다 효과를 셈해 보면 이렇습니다.

신용카드 공제가 45만 원인데 세금은 1만 2,150원만 줄어드는 것은, 과세표준이 6% 구간에 있는 데다 근로소득세액공제도 산출세액에 비례해 함께 줄기 때문입니다. 보험료 쪽은 오히려 손해입니다. 보험료·의료비·교육비·기부금 세액공제를 신청하면 표준세액공제 13만 원을 받을 수 없어서(제59조의4 제9항 제1호), 세액공제 합계가 13만 원에 못 미치면 신청하지 않는 편이 낫습니다. 의료비는 총급여의 3%를 넘는 부분부터 공제되므로(제59조의4 제2항) 근로기간에 큰 병원비를 쓴 경우에만 챙길 값어치가 있습니다.

정리하면 퇴사 뒤 5월 신고에서 챙길 1순위는 부양가족 기본공제, 그다음이 근로기간 중 큰 의료비이고, 소액 보험료는 표준세액공제와 견줘 보고 정하면 됩니다.

5월 종합소득세 신고로 넣는 방법

근로소득만 있는 사람은 회사가 연말정산을 했으므로 5월에 따로 신고하지 않아도 됩니다(소득세법 제73조 제1항 제1호). 신고할 의무가 없다는 뜻이지 신고할 수 없다는 뜻은 아니어서, 빠진 공제를 넣고 싶으면 다음 해 5월 1일부터 5월 31일까지 종합소득세 확정신고를 하면 됩니다(제70조 제1항). 이때 회사에서 받은 원천징수영수증의 기납부세액이 그대로 이어지고, 새로 넣은 공제만큼 줄어든 결정세액과의 차이를 돌려받습니다.

5월을 놓쳤어도 늦지 않습니다. 연말정산으로 소득세를 내고 지급명세서가 제출된 근로자는 경정청구를 할 수 있고, 기간은 법정신고기한이 지난 후 5년 이내입니다(국세기본법 제45조의2 제1항·제5항). 세무서장은 청구를 받은 날부터 2개월 안에 결과를 알려야 합니다(같은 조 제3항). 2026년에 퇴사한 해의 공제라면 2031년까지 되찾을 기회가 남아 있는 셈입니다.

신고서에 붙일 증명서류는 국세청 간소화 자료로 대부분 불러올 수 있지만, 기간을 나눠 넣어야 하는 항목은 직접 걸러야 합니다. 의료비와 카드 사용액을 불러올 때 퇴사일 이후 날짜의 금액은 빼고 넣는 것이 핵심입니다. 증명서류를 내지 않은 채 확정신고를 하면 본인 기본공제와 표준세액공제만 적용되므로(제54조 제2항 본문), 서류를 챙겨 함께 내야 합니다.

같은 해에 다시 취업했다면

퇴사한 해 안에 다른 회사에 들어갔다면 5월까지 기다릴 필요가 없습니다. 새 회사는 전 근무지의 근로소득 원천징수영수증과 근로소득 원천징수부 사본을 받아, 두 회사의 근로소득을 합친 금액으로 이듬해 2월에 연말정산을 합니다(소득세법 시행령 제197조 제1항). 근로소득공제도 합계액을 총급여로 보고 한 번만 계산합니다(소득세법 제47조 제5항).

이때 공제는 전 직장 근무기간과 새 직장 근무기간을 합친 근로기간 동안 쓴 돈이 들어가고, 두 직장 사이에 쉬던 기간에 쓴 돈은 빠집니다. 전 직장 원천징수영수증을 새 회사에 내지 않아 합산 정산이 안 되면, 두 곳에서 근로소득을 받은 사람은 확정신고 예외가 적용되지 않아 5월에 두 소득을 합쳐 직접 신고해야 합니다(제73조 제2항). 두 곳이 각자 낮은 세율로 정산해 둔 탓에 합치면 세금을 더 내는 경우가 많으므로, 새 회사 첫 연말정산 때 영수증을 함께 내는 편이 가장 간단합니다.

구직급여와 퇴직금은 이 정산에 들어가지 않습니다

퇴사 후 고용센터에서 받는 구직급여는 고용보험법에 따른 실업급여라 소득세가 붙지 않는 비과세소득입니다(소득세법 제12조 제3호 마목). 그래서 연말정산의 총급여에도, 5월 신고의 종합소득에도 더하지 않습니다. 구직급여를 몇 달 받았다고 부양가족 공제 요건이나 세율 구간이 바뀌지 않는다는 뜻입니다. 얼마를 며칠 받는지는 2026년 실업급여 계산에서 따로 볼 수 있습니다.

퇴직금도 근로소득이 아니라 퇴직소득으로 따로 세금을 매깁니다. 연말정산과 섞이지 않고 회사가 퇴직금을 줄 때 따로 떼므로, 얼마가 빠지는지는 퇴직소득세 계산을 보는 편이 맞습니다. 퇴사 후 바뀌는 국민연금과 건강보험은 퇴사 후 국민연금 2026과 퇴사 후 건강보험료 2026에 정리해 두었습니다.

확인하지 못한 것과 계산에서 정한 것

• 근로제공기간 지출분만 공제한다는 기준은 법 조문에 날짜로 적혀 있지 않고, 국세청 안내와 국세상담센터 답변(소득세법 집행기준 52-0-1)을 따른 것입니다. 주택자금 공제의 기간 처리는 이번 글에서 확인하지 못했습니다.
• **연금저축·IRP 납입액(연금계좌세액공제)**을 퇴사 뒤에 낸 경우의 처리는 이번 글에서 원문으로 확인하지 못했습니다.
• 사례는 비과세 수당이 없고, 국민연금·건강보험료 공제를 넣지 않고, 공제신고서를 내지 않은 경우로 정해 계산했습니다. 매달 뗀 세액은 간이세액표 100% 기준입니다.
• 개인지방소득세는 소득세의 10%로 어림했으며, 원 단위 끝수는 실제 정산과 다를 수 있습니다.
• 홈택스 메뉴 이름과 화면 경로는 해마다 바뀔 수 있어 적지 않았습니다.

정리하면

한 해 중간에 퇴사하면 연말정산은 퇴사 달 급여에서 끝나고, 공제신고서를 내지 않았으면 본인 기본공제와 표준세액공제만 들어갑니다. 반년 치 소득은 낮은 세율 구간에 걸리므로 이것만으로도 대개 뗀 세금의 상당 부분이 돌아옵니다. 빠진 공제는 다음 해 5월 신고나 5년 안의 경정청구로 넣을 수 있지만, 보험료·의료비·교육비·카드는 근무한 기간에 쓴 돈만 들어갑니다. 5월에는 부양가족 기본공제와 근로기간 중 큰 의료비부터 챙기고, 같은 해 재취업했다면 전 직장 원천징수영수증을 새 회사에 내는 것으로 정리하면 됩니다.

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